脂肪肝實驗室檢查的異常，視脂肪侵蝕的程度、范圍和病因而定，單純輕度脂肪肝的實驗室檢查可無明顯異常，中、重度脂肪肝由于脂肪囊腫的破裂及肥大的脂肪細胞壓迫膽道，可出現血清轉氨酶升高，谷草轉氨酶(AST)高于谷丙轉氨酶(ALT)，血清膽紅素輕至中度升高。若脂肪沉積在肝小葉中心帶，影響肝對色素的代謝，可出現酚四溴酞鈉(BSP)和靛青綠(ICG)排泄異常。此外，血清脂蛋白質和量亦可發生異常，表現為α1、α2、β球蛋白比例升高，白、球蛋白比例失調，血清堿性磷酸酶水平可以升高，有較高的敏感性，但特異性差。然而據經肝活檢證實的脂肪肝僅有 20%- 30%的病人有上述一項或一項以上指標異常，因而實驗室檢查并不能確切反應脂肪肝性疾。